本发明公开了一种机关事务管理系统，包括多个身份识别卡、业务管理部、多个内务机关子系统以及多个业务机关子系统。内务机关子系统包括第一采集单元、第一审核单元、第一开关单元，第一采集单元获取身份识别卡的至少一个类别数据，第一审核单元确定该身份识别卡的权限并控制所述内务机关子系统的门禁装置的开闭。业务机关子系统包括第一存储单元、第二存储单元、第二采集单元、第二审核单元、第二开关单元。业务业务管理部提供任意业务机关子系统每日的总业务量，在预设周期内分配该业务总量，通过调节进入预设周期内的流量，达到管理机关事务的目的。本发明将访客的权限分为对内的第一权限和对外的第二权限，提高出入管理效率。