一种承台基础结构防水施工方法，应用于基坑，包括以下步骤：在基坑的底面挖多个承台槽，并在每个承台槽的底部挖集水井；向每个承台槽的底部浇筑砼垫层，并在每个砼垫层的四周砌筑砖胎膜；在多个砖胎膜之间填充侧垫层；向每个砼垫层的上表面浇筑基础垫层，以使得基础垫层的上表面远离集水井的一侧高于靠近集水井的一侧；在多个基础垫层的上表面、多个集水井的表面、多个砖胎膜的表面和侧垫层的上表面铺设第一防水层；将排水装置设置于任一集水井中，并在多个承台槽之间搭设虹吸系统，以使得多个承台槽内的积水通过虹吸系统汇入设有排水装置的集水井中，并通过排水装置排出基坑。通过上述方法可以解决承台积水后的排水速度慢、防水效果差的问题。