本发明公开了一种医药废水处理装置及方法，属于医药废水处理领域。本发明的处理装置包括还原罐、过滤装置和反应仓，还原罐内部设置有零价铁填料层，废水通过管道连接至零价铁填料层下方，废水自下而上接触零价铁填料进行还原反应，并维持废水pH在一定范围内，而后进入反应仓中，投加过氧化氢溶液并曝气处理，搅拌发生催化氧化反应，最终得到处理后的废水。本发明的处理方法能够有效去除医药废水中的难降解有机物并且提高废水生化性。