本申请属于飞机液压系统领域，提供了一种电动增压储能流量补偿的机载应急液压系统及方法，其中系统包括蓄能器、电机和高压泵，机载液压系统的供油端通过供油单向阀与蓄能器连通，机载液压系统的回油端通过高压泵和单向阀连接蓄能器，电机连接并控制高压泵；蓄能器通过电磁阀连接机载液压用户。本发明可以为机载液压用户提供瞬时高压大流量，减小飞机液压系统的装机功率，较马达增压储能方案效率更高，对电机和高压泵的需求功率尺寸规格更小，有利于减轻液压系统重量；本发明系统组成简单，在主液压系统或电机出现故障时仍可工作，且可以作为应急液压能源使用，具有更高的可靠性。