本发明涉及水生态环境评估技术领域，且公开了一种水生态环境的评估系统；本水生态环境的评估系统包括数据处理系统、可见数据采集系统、不可见数据采集系统、数据统计计算系统、模型对比系统、环境预测系统以及结果输出系统，所述数据处理系统用于对水生态环境的评估系统中的所有数据进行集中处理，所述所有数据包括采集数据以及评估数据，本发明对数据及统计即标准化处理后，再通过对比模型将其与历史数据进行对比，从而得出该水生态环境的评估结果，且可由评估结果和历史数据进行未来一定时间内的环境变化预测，不仅做到了环境评估，还可以做到环境预测，为生态评估带来了更加科学以及智能的评估结果。