本发明提供了一种受试者数据处理方法、系统及电子设备，属于大数据的技术领域，缓解了现有技术存在的体检数据的分析不够准确的问题。该方法包括：将受试者进行双盲随机分组，并存储每个受试者所属的组别；获取受试者的第一次体检数据；获取受试者的样品使用数据，基于样品使用数据将受试者分为多个依从性等级，并确定每个依从性等级对应的权重值；获取受试者的第二次体检数据；将各个依从性等级的受试者的第一次体检数据和第二次体检数据进行比较，得到不同依从性等级下的体检数据差值；将不同依从性等级下的体检数据差值以相对应的权重值进行加权，获得依从性差值；根据不同组别的依从性差值获得样品效果数据。