本发明提供一种医疗报销业务处理方法、装置、系统及存储介质，本发明提供的方法涉及智能医疗技术领域，该方法应用于报销终端，包括：接收用户终端发送的医疗报销请求，根据医疗报销请求获得目标就诊凭证，并从联盟区块链中获取目标就诊凭证对应的目标医疗报销信息；根据预设密钥对目标医疗报销信息进行解密获得明文的目标医疗业务信息，并根据目标医疗业务信息进行医疗报销业务处理。本发明提供的医疗报销业务处理方法，通过利用联盟区块链中存储的医疗报销信息以及就诊凭证进行医保报销核验，提高了医保报销业务处理的效率。