本发明公开了一种新型的微流控芯片与数字化荧光定量PCR扩增仪，所述芯片由上层芯片与下层芯片组合而成，其中所述上层芯片设置有预混液的溶液进样口、细胞组织样液进样口、洗涤溶液进样口、洗脱溶液进样口、第一废液收集腔、油相收集腔、去油通道与混合流道；所述下层芯片设置有多通道液滴生成流道、第二废液收集腔与液滴收集腔。本发明设置了多通道液滴生成流道，大大促进了液滴生成的效率，显著提高了PCR扩增的效率。本发明结合了预处理模块，利用磁珠法核酸提取法实现细胞的裂解，从而顺利进行后续的PCR反应。且本发明设置了特殊的去油微结构，使用被动去油的方法，使凝胶完成后快速脱离油相，保证内容物的稳定。