本发明公开了一种多层包裹微流控芯片，所述芯片包括样液注入口、水相鞘液注入口、第一层包裹油相物质注入口、第二层包裹水相物质注入口、第三层包裹油相物质注入口、第四层包裹水相物质注入口、去油通道、表面活性剂注入口、干细胞颗粒收集腔。本发明的有益效果在于，实现了高通量，集成化的同时，利用微流控芯片通过控制分散相通入的速度，制备出均一性良好的多层包裹微流控液滴，分开的单一流道无需担心水油融合而加入催化剂，不需要装置组装，且在液滴形成出加入温控装置，使生成的液滴快速凝胶化，使效率变得更高。解决了液滴形成速度以及通量等问题。