本发明公开了一种unity多工程打包Android项目生成aar的方法、系统及电子设备，其中方法包括：利用unity生成多工程的Android项目，每个工程对应一个场景；在各个工程的信息描述文件中，配置属性标签；在unity的多工程中构建打包任务，生成发布版的aar包；将aar包解压，剔除解压后的文件中的jar包和so包；将剔除的jar包和so包分别放入主工程中；在主工程对应的工具构建文件中添加ndk支持，运行Android项目。本发明通过在各个工程的信息描述文件中配置属性标签来保持样式主题一致，并且区分不同工程对应的unity场景，通过剔除解压后的文件中的jar包和so包并将剔除的jar包和so包分别放入主工程中来避免发生冲突造成报错，解决了unity多工程打包aar中aar包解压出的多个so包重复的问题。