本发明公开了一种微生物诱导钙沉淀同步去除有机物的方法及反应器，包括：生物诱导钙沉淀污泥的富集培养，向水样和污泥的混合中加入营养液I培养后收集沉淀污泥；向沉淀污泥中加入营养液II进行培养，所得沉淀物再次培养获得驯化后的钙沉淀细菌制成生物菌剂，通过富集驯化获得钙沉淀细菌的生物菌剂，将菌剂于陶粒上进行生物挂膜，再将陶粒装填至反应器中进行制药废水的处理。通过生物诱导碳酸钙沉淀技术在进行钙沉淀的同时，通过碳酸钙沉淀吸附包裹有机物，有效解决制药废水中有机物污染，提高有机物的去除率，实现生物处理工业废水。