本发明涉及一种异常病例点数结算管理系统，包括：数据采集及质量管理模块用以采集基础医疗数据；数据360°分析与展现模块用以从多个维度上反映差距；异常病种点数结算支付管理模块，形成DRGs‑PPS制度，以组为单位打包确定医保支付标准；数据上报与检测模块用以展示数据情况；医疗服务绩效评价模块，依据治疗难度和治疗成本的高低赋予不同权重，实现同组内病例直接比较治疗效果，不同组病例按权重进行调整后比较治疗结果；医疗费用支付模块，用以对医疗综合费用、单病种控费、患者异常住院费用进行统计与分析；区域平台管理模块，用以对全市医疗机构排名和综合分析。合理性更好，有助于实现多方共赢的医改目标。