本发明涉及一种河道流域水生态修复集成治理方法及辅助工具，包括若浮岛单元；每个所述的浮岛单元之间通过拉索相接；所述的浮岛单元底部设置有容纳底座；所述的浮岛本体和容纳底座内分别设置有第一空腔和第二空腔；所述的第一空腔中存放有修复液体；所述的容纳底座上部内侧设置有第一连接部；所述浮岛单元的底部内侧设置有第二连接部。本发明具备以下有益效果：浮岛单元可和容纳底座共同沉底，在分离之后，浮岛单元在上升的过程中，修复液会从第一空腔中向外泄露、渗透，伴随上升过程，和搅拌叶片，可与河流中各个深度的水流进行混合，大大提高修复液的混合均匀度、修复液覆盖范围和修复效果。