本发明涉及一种研发投资决策系统，包括数据采集模块、数据预处理模块、数据分析模块、数据输出模块；所述数据采集模块用于采集研发投资决策的初始数据；所述数据预处理模块用于将所述初始数据进行预处理得到分析数据；所述数据分析模块用于接收所述分析数据并将其导入至投资价值分析模型中进行分析，得到投资决策；所述数据输出模块用于将所述投资决策输出；所述投资价值分析模型包括领导者和追随者博弈模型，所述领导者和追随者博弈模型由研发项目整体完成时领导者和追随者博弈得出。