本发明提供一种海洋平台通风系统在线风平衡控制方法和控制系统。该方法通过设置每个舱室出风口的目标出风量，采集每个舱室出风口的实时出风量，计算每个出风口实际出风量与目标出风量的比值r_x；并将各比值调节至一致r^*；再根据r^*调节总风机转速，进而使各出风口风量达到平衡。针对海洋平台通风系统多出风口控制的要求，将多智能体一致性协同控制应用到海洋平台通风系统的风平衡问题中。发明不需要专门的通风系统维护或调试时间，可在线调节，在通风系统正常运行时使用该发明进行风平衡，在实际应用中减小了对通风系统使用方造成的影响。