本发明提供一种富含锰的枯草芽孢杆菌及应用方法，所提供的富含锰的枯草芽孢杆菌菌株的保藏编号为CGMCC No.23751。本发明提供一种高耐受锰的菌种。本发明驯化后的菌能够耐受高浓度的Mn²⁺离子，并且能够稳定的生长，且具有明显的抗高温特性，适合畜禽颗粒饲料加工中的耐高温的要求。所获得菌株具有补锰和促进饲料利用率双重功效。本发明的菌株能够将无机锰大部分转化成有机锰，不仅能够达到补锰的作用，更能增强动物免疫力，提高饲料利用率。所获得的菌株具有能促进机体生长发育和提高饲料转化率的功能。所获得菌株具有促进其它益生菌生长、提高该益生菌产生多种酶类，如淀粉酶、脂肪酶和小肽。