本发明属于制氢系统技术领域，公开了一种中压直流汇集型可再生能源发电制氢系统及其工作方法，所述的系统包括可再生能源发电单元、中压直流母线、制氢单元、储能单元以及辅机及安全供电单元，可再生能源发电单元通过输入侧电能变换单元与中压直流母线连接，制氢单元、储能单元以及辅机及安全供电单元通过输出侧电能变换单元与中压直流母线连接。所述的方法包括如下步骤：进行启动；正常运行并进行动态功率调节；判断系统是否停机。本发明解决了现有技术存在的大规模可再生能源发电与电解水装置的电能耦合问题，占用公共电网容量，煤电污染严重，稳定性和安全性差，连接线路电流过大，损耗过大，系统效率过低，电缆造价过高的问题。