本发明提供一种PCIe板卡固件调试的方法、系统、设备和存储介质，方法包括：在主机侧设置PCIe调试服务，并在PCIe板卡侧设置PCIe调试程序；基于所述PCIe调试服务按照预设格式组织第一命令包，并将所述第一命令包提交到主机双倍速率同步动态随机存储器内；响应于板卡双倍速率同步动态随机存储器接收到中断信号，从所述主机双倍速率同步动态随机存储器获取命令并执行，将执行结果按照命令格式组织第二命令包，并将所述第二命令包返回所述主机双倍速率同步动态随机存储器；以及响应于接收到完成中断的信号，从所述主机双倍速率同步动态随机存储器读取所述第二命令包，并将执行结果进行展示。本发明不需要外接其他接口，可以带内完成PCIe板卡固件的调试。