本发明提供一种基于MBR膜生物反应器的污水处理方法，在缺氧处理中，先进行酸化处理，将非溶解态有机物截留并逐步转变为溶解态有机物。在缺氧段进行反硝化处理，以进行脱氮；之后进入好氧池中，在好氧池中，通过溶解氧浓度的逐渐增加，发挥聚磷菌的优势。在好氧池中，为发挥聚磷菌的优势，根据温度调整污泥浓度，提高除磷效果。且本发明在MBR膜生物反应器进行固液分离时，取消了现有技术中框架式反应器结构，增加曝气面积，使得曝气效率提高，曝气管的设计减少了膜组件的污染。且曝气管通过多个曝气口对膜组件进行曝气处理，根据当前的曝气量调整曝气口数量，针对性的提高固液分离的能力。