本发明公开了一种分离式热管反应堆，整个分离式热管反应堆的堆芯由两个相同的半堆芯组成；反应堆堆芯的基本组件是堆芯热管和燃料元件，堆芯热管在燃料元件间布置；反应堆中堆芯热管穿过轴向反射层，在反应堆堆芯外形成一个带有长热管的热交换器；长热管的蒸发段插入热交换器中，在穿过屏蔽层后与能量转换装置相连，从而实现热能到电能的转换；反应堆的一个半堆芯固定在屏蔽层上，另一半堆芯连接到机械摆臂上，机械摆臂的一端与屏蔽层外的一个枢轴连接，通过机械摆臂的摆动来控制两个半堆芯之间的间距，进而来控制反应堆的反应性；在整个反应堆的上端布置有一个安全锁，用来限制机械摆臂摆动时引入的反应性大小，还可以实现反应堆的紧急停堆。