本发明属于酿酒废弃物资源循环再利用领域，公开了一种基于酒糟和窖泥的酒用高粱育苗基质及其制备方法。所述酒用高粱育苗基质为有机育苗基质或生态育苗基质，所述有机育苗基质中包含有机育苗基质主料，所述生态育苗基质中包含生态育苗基质主料，以及水，其中，水的质量为基质主料质量的25‑35％；按重量份数计，所述有机育苗基质主料包含堆腐原物料35‑45份，堆腐粉碎物料15‑20份，草炭35‑50份，且堆腐原物料与堆腐粉碎物料的质量比为1.5‑2：1；按重量份数计，所述生态育苗基质主料包含堆腐粉碎物料30‑50份，草炭20‑30份，珍珠岩15‑20份，蛭石15‑20份。本发明将白酒酒糟和窖泥经过腐熟处理后，生产酒用有机高粱专用育苗基质，实现了酒用高粱产业和酿酒产业的绿色循环发展。