本发明公开一种镁合金薄壁筒体的加工系统，涉及镁合金筒体加工技术领域，解决了相关技术中镁合金薄壁筒体加工存在防火、散热要求、生产效率低、成本不低的技术问题。加工系统包括铣内孔，铣内孔包括支撑滚轮工装、冷却液输送机构和第一工装夹具，支撑滚轮工装的轮面开设有过液槽，支撑滚轮工装的轮体由非金属耐磨材质制成，支撑滚轮工装以支撑镁合金薄壁筒体的外筒面，冷却液输送机构以输送冷却液至过液槽，第一工装夹具以夹持镁合金薄壁筒体的小端。本系统解决了镁合金加工易燃的安全隐患，可以像加工铝合金材料一样，加工镁合金材料的壳体零件，效率及安全性大大提高，另一方面有利于成本控制。