本发明公开了一种基于多肽有机肥的制造设备，包括混料罐和挤出管，混料罐的出料口与挤出管的进料口连接；混料罐顶部设置有投料管和注水管，混料罐顶部安装有混料电机，混料电机的输出端连接有旋转轴，旋转轴上安装有搅拌叶片；挤出管上安装有挤出电机，挤出电机的输出端连接有第一挤出蛟龙，第一挤出绞龙上安装有第一绞龙叶片，第一绞龙叶片上设置有狭缝，第一挤出蛟龙通过减速器连接有第二挤出绞龙，第二挤出绞龙上安装有第二绞龙叶片，挤出管的出料端安装有孔板，孔板的外侧安装有旋转切刀，旋转切刀与第二绞龙叶片连接。本发明能够改进现有技术的不足，实现单一设备对多肽有机肥的直接生产，集成度高，占地面积小。