本发明公开一种基于微波遥感的土壤湿度监测系统，包括监测获取系统和智能处理系统，所述监测获取系统包括影像数据获取模块、预处理模块和数据传输模块，所述智能处理模块包括影像数据处理模块、湿度获取评价模块和数据存储模块；本发明通过预处理模块基于深度学习处理模型并根据监测地的植被卫星覆盖图像对获取的数据进行适应性自动调整，大大降低植被覆盖面积和厚度及绿植的种类对微波遥感的影响，使得获取的数据更加准确，同时通过对数据进行双重消噪处理，使得影像及数据更加清晰，保证了后续的反演计算和评价获得结果的有效性和准确度。