本申请提供了安卓应用程序反调试的方法、系统、电子设备和存储介质，包括：获取与待反调试安卓应用程序的主进程相对应的远程服务进程，所述远程服务进程为独立进程且与所述主进程存在业务关联；当所述待反调试安卓应用程序启动时，对所述主进程和远程服务进程进行反调试检查；如果所述主进程和远程服务进程均处于不被调试状态，则建立包含所述主进程和远程服务进程的进程监控列表；根据预设的反调试检查条件对所述进程监控列表中的主进程和远程服务进程进行反调试检查，如果存在被调试的进程，则停止所述被调试的进程。使得远程服务进程被停止时，主进程并不能继续运行，调试程序不能在杀死远程服务程序的情况下获取应用程序的全部运行流程。