本发明提供了一种医疗设备运行状态判定方法及系统，针对目前依靠人工设定阈值来判断设备运行状态的判定方法的误识比率高的问题，通过采集设备的业务数据，根据现场状态，标记采集数据的状态，得到有状态类别标注的样本集合；基于设备的现场状态切换与设备的原理，描述设备业务状态转移过程，计算业务状态转移序列集；使用有标注的样本集合训练支持向量机分类器，针对设备的历史无标注业务数据样本，计算无标注样本和有标注样本的距离，选取最近距离样本使用分类器分类，利用设备业务状态转移序列集校验分类结果，将可接受的分类结果加入到标注样本集合，重新训练分类器。即解决了标注样本成本太高的问题，又实现了状态识别准确率的提升。