本发明提供一种市郊铁路车载设备切换方法及系统，方法包括：确定切换模块接收到的切换指令；根据所述切换指令，控制所述切换模块撤销处于控车状态的第一车载设备的控车权以及将所述控车权切换到处于备用控车状态的第二车载设备，以由所述第二车载设备控制列车在市郊铁路运行；其中，所述切换模块分别与所述第一车载设备和所述第二车载设备通信连接。所述系统执行所述方法。本发明针对市域铁路列控系统车载设备切换所存在的难点，提出了一种新的市域铁路车载设备切换方法，利用切换模块实现了车载设备不停车自动切换的功能，并且具备维护工作量小、施工便捷、占用空间小等特点，满足了市域铁路的运营需求。