本发明提供一种动态调度多核融合计算处理器的方法及其系统，该方法包括启动运行系统调度程序，调度任务至融合处理器管理程序；读取用户预设的场景类型信息，并设置不同场景类型信息的权重；收集各个应用任务信息，对各个任务负载进行估算；制定计算节点分配方案；根据应用场景信息、调度到融合处理器的任务信息、融合处理器的资源信息，配置融合处理器的计算节点类型，派发相应任务到计算节点，动态调度融合处理器，从而形成同构或异构多核处理器系统。本发明系统应用于上述的方法。本发明可以解决现有技术中存在的不足，能够自动地分析系统的工作状态并做出合理的任务分配和调度，可以最大化发挥融合处理器的性能。