本发明提供一种针对透射电镜包埋剂冷冻保存的改进方法。该方法包括：配制包埋剂，采用医用注射器抽取包埋剂，对其开口进行封堵；用塑料封口袋密封包好，置于冰箱冷冻室中保存；使用前，取出冷冻的包埋剂进行解冻，利用医用注射器滴注包埋剂于容器中对组织标本进行半浸透处理及全浸透处理，之后对胶囊灌注进行常规包埋和聚合。本发明的保存法所得包埋块聚合硬度适中，半浸透及全浸透效果满意；制片过程顺畅，切片皱褶、颤痕少，染色对比度反差明显，组织超微结构清晰可辨，且各细胞结构及亚结构保存完整，染色效果理想；同样能够满足临床诊断以及科研需要，并且使用注射器对胶囊灌注包埋剂时，可直达胶囊底部，避免了传统滴灌法产生的大量气泡。