本发明公开了基于手机信令数据的轨道交通出行者全出行链分析方法，包括：提取轨道交通出行者的手机信令数据信息，识别出行者的出行轨迹段、途经站点及起终站点数据；基于轨道交通线网拓扑结构，根据出行者每一趟次的出行轨迹段和途经站点，对出行者每一趟次的换乘站点进行识别，得到出行者真实的出行轨迹及换乘站点序列；识别得到出行者每一趟次的来源地和去向地并进行验证；根据出行者每一趟次的来源地和去向地对出行者对应趟次的出行轨迹进行分段，识别得到出行者的接驳方式，由此得到出行者的全出行链分析结果。本发明实现轨道出行者的全出行链分析，对研究轨道系统的运行现状，从而根据现状需求，进行线网规划与调整具有重要的意义。