本发明公开了一种循环冷却水处理自动控制系统及控制方法，涉及冷却水处理技术领域，包括压缩空气装置、杀菌剂存储结构、酸试剂存储结构、取样水管路、循环管路和控制器，取样水管路包括第一取样水管路，压缩空气装置与第一取样水管路连通，压缩空气装置用于向第一取样水管路内通入压缩空气，第一取样水管路上设置有pH传感器、ORP传感器或余氯传感器，循环管路的两端均与第一取样水管路连通，杀菌剂存储结构与第一取样水管路或循环管路连通，酸试剂存储结构与第一取样水管路或循环管路连通。本发明可对取样水管路的传感器进行清洗，确保传感器监测的准确性和稳定性，维持冷却水处理的有效性及稳定性，提升冷却水处理效率。