本发明公开了一种新型扫描数据注册方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、船体划分：将船体按照扫描注册的方案进行整体划分，划分成不同站点，具体为船体结构、船内设备、管路系统、排水系统和脱硫系统；S2、参数设定：对三维激光点云扫描仪的姿态信息和中心初始位置进行设定，本发明一种新型扫描数据注册方法，通过云对云和俯视图的方法，通过每两站点之间的公共部分自动注册，无需人为设定公共目标物，提高操作人员的工作效率，因为利用俯视图和云对云方法进行注册，两站之间原船公共部分可以充分接触，可以大大提高注册的精度及降低注册错误率，同时在扫描的时候可以不用刻意去布置标靶球或棋盘格，间接地提高了扫描的效率。