本发明公开了一种畜牧兽医用具有消毒功能的清洗装置及使用方法，包括箱体，所述箱体左侧表面底部的前侧安装有进液装置，所述箱体右侧表面底部的中心处安装有喷洒装置，所述箱体右侧表面的前侧安装有控制面板，所述箱体内腔的底部焊接有清洗箱，所述清洗箱内腔底部的四角均安装有超声波发生器，所述清洗箱上安装有搅动装置。本发明可在清洗时对畜牧兽医工具进行消毒，这样清洗装置的清洗效果更好，解决了清洗装置在对畜牧兽医工具进行清洗时，因无法完成消毒作业，使得畜牧兽医工具表面的细菌无法被杀死，再次使用时极易对牲畜产生危害，从而导致清洗装置出现清洗畜牧兽医工具效果较差的问题。