本申请涉及包装材料制备技术领域，尤其是一种具有细菌阻隔防护功能的复合包装膜及其制备方法。一种具有细菌阻隔防护功能的复合包装膜，包括复合包装膜主体，复合包装膜主体包括内抗菌膜层、从下至上依次复合于内抗菌膜层的第一自愈阻隔粘结层、增强阻隔防护膜层、第二自愈阻隔粘结层、外防护层，增强阻隔防护膜层是由以下原料制备而成：PVDC树脂、硫酸钡粉料、丙酸钙、纳米二氧化钛、滑石粉、表面改进剂、光预聚物A；第一自愈阻隔粘结层和第二自愈阻隔粘结层皆是采用自愈阻隔树脂制备而成；自愈阻隔树脂中包含有光预聚物B和光引发剂。本申请中制备的复合包装膜对气体具有较好阻隔效果且对细菌也有较好杀灭、阻隔的效果。