一种水体污染治理设备控制系统，涉及水污染处理设备技术领域。浮筒设置于水循环机构四周，拉板机构设置于水循环机构底部，拉板机构、撑板机构、拉杆机构、锚固墩垂直向下依次活动连接；所述水循环机构包含进气管、喉管、循环排水管、底管、叶轮机，进气管、喉管、底管、叶轮机垂直向下依次连接，循环排水管设置于喉管两侧。通过将底部水体提升至表层产生循环水流，循环水流在分层水体跃温层处诱导产生内波而混合水体，垂向内波运动使藻类受光照剧烈波动，协同利用太阳能板遮光，抑制藻类生长，同时混合充氧促进水体自净、抑制底泥内源污染，在设备使用过程中可方便的控制锚固墩的自动升降，方便设备的移动及固定。