本发明公开了一种土壤呼吸监测仪校准装置以及校准方法，属于土壤呼吸监测技术领域；一种土壤呼吸监测仪校准装置以及校准方法，依据质量守恒定律，即校准装置仪器内部的二氧化碳减少的量等于实际二氧化碳排放量，结合气体通量定义，提出了两种计算实验中二氧化碳通量的方法，进一步保证了实验过程中二氧化碳通量计算的准确性，将计算所得的两组二氧化碳通量数据与需校准的土壤呼吸监测仪所测得的数据进行的对比分析，更好的保证了土壤呼吸监测仪校准工作的进行；与市面上常见的设计相比，本发明的适用范围更广，校准方式更为多样，同时校准结果更为准确。