基于时序大数据及转移熵的基因表达调控网络构建方法
实质审查的生效
摘要

本发明涉及一种基于时序大数据及转移熵的基因表达调控网络构建方法,包括时序数据采样、时间序列大数据预处理、目标基因筛选、转移熵并行计算、基因调控关系筛选、构建基因表达调控网络这6个步骤,本方法的时间序列数据为大于等于3个时间点的多态时间序列基因表达谱矩阵数据,作为构建基因调控网络的原始数据,通过使用转移熵作为基因之间的基因因果调控关系推理指标,用于确定基因之间的因果调控关系,并基于内存计算框架Spark的转移熵分布式并行计算方法,转移熵并行计算负责计算大规模基因之间的转移熵,从而构建基因调控网络。

基本信息
专利标题 :
基于时序大数据及转移熵的基因表达调控网络构建方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114360634A
申请号 :
CN202111648628.9
公开(公告)日 :
2022-04-15
申请日 :
2021-12-29
授权号 :
暂无
授权日 :
暂无
发明人 :
高静李涛刘振羽
申请人 :
高静;李涛;刘振羽
申请人地址 :
内蒙古自治区呼和浩特市赛罕区鄂尔多斯东街内蒙古农业大学新校区计算机与信息工程学院
代理机构 :
北京汇智英财专利代理事务所(普通合伙)
代理人 :
张伟
优先权 :
CN202111648628.9
主分类号 :
G16B5/00
IPC分类号 :
G16B5/00  G16B40/30  
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学,例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B5/00
特别适用于生物系统的建模或仿真,例如遗传基因管理网络、蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络的ICT
法律状态
2022-05-03 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 5/00
申请日 : 20211229
2022-04-15 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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