本发明提供了一种山鸡椒水芹烯合成酶在制备萜烯类化合物及包含萜烯类化合物的产品中的应用，涉及生物技术领域，水芹烯是山鸡椒果实精油的主要成分和活性成分，其合成受水芹烯合成酶的调控。本发明发现山鸡椒水芹烯合成酶还能够催化合成水芹烯、香叶醇、α‑蒎烯、β‑蒎烯、β‑月桂烯和柠檬烯，是一种催化多产物的合成酶，因此本发明提供了山鸡椒水芹烯合成酶在制备水芹烯、香叶醇、α‑蒎烯、β‑蒎烯、β‑月桂烯和柠檬烯中至少一种的应用。以山鸡椒水芹烯合成酶催化底物合成萜烯类化合物的过程接近生物天然合成过程，合成效率高，中间产物和其他非目的产物的杂质含量低，并且避免了传统的化学合成中化学物质的污染。