本发明涉及一种兆瓦级氢储能电站容量配置方法及系统。所述方法包括：生成待搜索空间；设置粒子结构；将粒子当前位置代入氢能综合利用系统运行规划，计算各粒子当前适应度；根据当前适应度更新粒子历史最优位置；根据历史最优位置计算粒子当前速度；据粒子当前位置和当前速度计算下一次迭代的当前位置；判断当前位置是否超出待搜索空间，若是，进行位置限制；若否，判断是否达到最大迭代次数或满足迭代退出条件，若是，返回进行下一次迭代计算；若否，将粒子群的历史全局最优位置输出，得到最优设备选型结果，并据此配置兆瓦级氢储能电站容量。采用本发明提供的方法，能够快速、高效地求解最优设备选型结果，提高兆瓦级氢储能电站容量配置效率。