本发明涉及水体取样技术领域，公开了一种水质监测深层水体取样装置，解决的技术方案包括：抽水泵，取样筒体，配重装置，水平隔板，将取样筒体密封分隔为第一腔室和第二腔室，第一腔室位于第二腔室的上方；多个透水孔，液位传感器，密封挡板，驱动机构，固定设置在第一腔室内，其驱动部件密封穿过第一腔室的侧壁；U型连杆，深度传感器，控制器，用于接收取样筒体的深度数据和第二腔室内的水位数据，当液位传感器检测到水位达到设定水位后，通过驱动机构控制密封挡板使第二腔室停止进水，当停止进水后，控制电磁阀和抽水泵开始抽水；这种水质监测深层水体取样装置，大大减少了取样操作次数，避免水样混合，而且结构简单，体积较小、使用方便。