本发明属于农作物检测技术领域，公开了一种基于作物模型与同化技术的作物长势遥感监测系统及方法，所述基于作物模型与同化技术的作物长势遥感监测系统包括：遥感数据获取模块、数据预处理模块、数据传输模块、中央控制模块、模型构建模块、作物长势监测模块、长势参数提取模块、长势参数同化模块、数据存储模块、更新显示模块。本发明提供的基于作物模型与同化技术的作物长势遥感监测系统，有效的提高了作物监测的精度，方法简便、易于大面积推广应用。同时本发明进行数据同化能够有效提高监测模型的监测精度，揭示长势变化规律，保证结果的稳定与可靠；显著提高了作物监测和灾损评估的精度，具有重要应用前景。