本发明涉及医疗系统技术领域，具体涉及一种基于互联网的智慧诊疗系统，包括功能服务子系统、平台子系统和用户子系统，功能服务子系统包括预约模块、问诊模块、药事模块、直播模块和付费模块，预约模块用于用户向医疗机构预约问诊时间；问诊模块用于在问诊时间内通过平台子系统将用户和医疗机构建立通信，进行线上问诊，得出电子病历和药品清单；药事模块，用于将药品清单发送给药店，并向用户实时显示药品的配货状态；付费模块用于通过政府获取所述用户的线上医保，并通过医保向医疗机构进行问诊结算和向药店进行购药结算，解决了现有的智慧诊疗系统的诊前、诊中和诊后三个环节相互独立，诊疗所花费的时间较长的问题。