本发明公开了一种地层中存在流水时的预控冻结方法，适用于地下施工技术领域。当地表下规划出的待开挖土体中存在贯穿待开挖土体区域的地层水流时，向包含贯穿水流的规划待开挖土体范围外侧布置一圈冻结孔，检测地层水流的流水方向，从而获得地层水流通过待开挖土体的入口和出口位置，在入口和出口的冷冻钻孔外侧增设补强冻结孔，使用入口和出口的冷接管以外的其余冻结管进行冻结，形成带有缺口的冻结帷幕，冻结过程中地层水流继续从流水通道中通过，最后启动入口及出口位置处的冻结管以及补强冻结管冻结从而封闭冻结帷幕，在冻结壁内部的待开挖土体中进行预期的开挖施工。其施工时间短，有效节约施工成本。