本公开提供一种去除发酵类抗生素生产废水中的污染物的方法，所述方法包括：采用金属负载的铁基催化剂对发酵类抗生素生产废水进行高温催化水解，得水解废水；采用混凝剂对水解废水进行混凝处理；采用含有钙离子的造粒调理剂对水解废水进行造粒处理。该方法通过采用金属负载的铁基催化剂催化高温水解，提高抗生素的水解效率，缩短反应时间，降低反应能耗；通过加入造粒调理剂，与混凝剂形成的絮体发生作用，形成密度和粒径更大的晶体结构；同时造粒调理剂中的钙离子与蛋白质发生反应，形成更多的α‑螺旋结构，促使蛋白质聚集，增强了废水中由蛋白质类物质所形成的悬浮固体的沉降性能，消除了高温催化水解工艺产生的悬浮固体对生化系统的不利影响。