本发明属于医疗技术领域，具体公开了一种医疗机构院感管理质量评估系统及方法。本发明的医疗机构院感管理质量评估系统包括系统管理模块、监督管理模块、风险管理模块、质量管理模块和结果分析模块，通过对各层面的监督检查结果进行统一整合、分类，量化存在的问题，利用客观的可视化的数据对各层次的医院感染管理风险进行评估，同时，利用风险评估结果，结合各层面要求建立院感质量评价体系，对全院及各科室医院感染管理质量进行评价打分；结合风险和质量评估结果，通过质量管理工具对存在风险及质量问题进行分析，拟定改进措施及下一步工作计划，实现客观高效的院感染管理质量评估及PDCA循环。