本发明提供了镁合金医用植入物及其制备方法，制备方法包括：提供镁合金，镁合金包括镁和至少一种活泼元素；对镁合金依次进行热氧化处理和后处理，得到镁合金医用植入物，镁合金医用植入物包括氧化物钝化层、中间层和镁合金基体。镁合金医用植入物具有与骨缺损匹配的定制化外形和包括表面的氧化物钝化层、中间层和镁合金基体的复合结构，氧化物钝化层和中间层在体液中降解较慢，隔开了镁合金基体与体液的接触，减缓了所述镁合金医用植入物的降解速率，使其降解周期与骨组织重建和功能恢复相匹配，提升了骨缺损修复效果。上述制备方法不受几何结构影响，不添加其它材料，降解周期可调，效果稳定，操作性强，便于工业化生产和临床应用。