本发明公开了一种基于复杂网络的科研人员数据处理方法。本发明方法包括数据采集与处理、科研合作网络构建、特征提取、结果评估四个模块。数据处理包括清理脏数据、补全遗失数据以及提取精准信息、作者重名处理和数据统计分析等。科研合作网络构建是项目合作网络和论文合作网络的构建。特征提取包括计量特征提取、网络拓扑特征提取和网络隐含特征提取，这三部分特征可以保证数据处理结果的准确性与可靠性。结果评估采用基于混淆矩阵的ROC曲线测试本专利的数据处理效果。本发明方法从数据挖掘和网络特征的角度研究国家自然科学基金等科研人员的科研数据，通过计量特征、网络拓扑特征和网络隐含特征对科研人员数据进行细致而准确的处理。