本发明公开了一种基于空间挖掘卷积自编码的动中通卫通设备故障诊断方法，从多领域故障特征空间挖掘的角度出发，采用卷积自编码器与弱监督信息和领域自适应相结合的方式，学习可迁移故障特征挖掘网络，进而与独特征挖掘网络构成故障特征提取的两个方面，将故障特征和独特征综合利用，并通过小样本学习的方式进行最终的故障特征提取与比较网络。本发明充分利用了设备运行过程中易于采集的健康数据，有效地进行领域迁移的学习；故障特征和独特征的联合应用，能够既考虑到不同数据领域中的公故障特征，又考虑到不同类别数据的差异性，能够获得更好的分类效果。本发明的训练方法采取了小样本学习的方法，有效解决了故障诊断问题中故障数据匮乏的问题。