本发明公开了智能化育苗系统，包括多层植物育苗架、封闭式育苗室和控制系统，所述控制系统包括控制主机、多层植物育苗架、封闭式育苗室、气体供给系统、温湿度控制系统、水肥自动循环系统、通风系统、LED补光系统、杀菌系统和定时模块，所述多层植物育苗架放置在封闭式育苗室内用于对植物的封闭式培育，所述通风系统、LED补光系统和杀菌系统均通过定时模块与控制主机连接；本智能化育苗系统将育苗空间封闭，由人工光全面代替太阳光，各育苗生产要素实现全面精准化控制，全年连续育苗，生产周期快，节约肥料，很大幅度降低育苗期的病虫害，可按计划定制，整个过程如同在工厂生产线上进行，从而使产品具有精细化、均质化和丰产性的特点。