本申请实施例公开了基于科目表的科目处理方法、装置及其设备，用于解决在企业信息管理系统运行过程中已产生大量科目相关历史数据的情况下，可以启用科目管控而不影响历史数据及其他组织对科目的使用的问题，同时可以避免产生大量科目冗余数据。本申请实施例方法包括：响应于针对多个组织共享的科目表的科目管控指令，创建所述科目表对应的科目分配信息表；响应于针对所述科目分配信息表的科目分配指令，在所述科目分配信息表中插入科目分配记录；响应于任一组织针对任一科目的目标操作请求，在所述科目分配信息表中查询科目分配记录；并根据查询出的科目分配记录中的科目标识，确定所述任一组织是否具有对所述任一科目的目标操作权限。